Соавтор экспертного заключения по делу Pussy Riot, которое легло в основу приговора.

13 сентября 2012 года на рабочей встрече с членами профильного комитета Госдумы инициировал возвращение уголовной ответственности за оскорбление чувств верующих. Понкин предложил вернуть 143-ю статью УК РСФСР ("нарушение свободы совести и вероисповедания").

Думский комитет уже приступил к разработке соответствующего законопроекта, сообщил его председатель Ярослав Нилов. Планируется ввести несколько видов наказаний за богохульство - штрафы, принудительные и исправительные работы, тюремное заключение.

Понкин - доктор юридических наук, председатель правления РОО "Институт государственно-конфессиональных отношений и права".

Начал бороться с сектантами еще во время службы на флоте. Пропагандист преподавания православной культуры в школах и вузах.

Эксперт по "делу о Говняшке" (признал мультфильм из сериала "Южный парк" произведением, возбуждающим религиозную вражду).

Проводил экспертизу текстов журналиста МК Сергея Бычкова, подавшего в прокуратуру заявление против Всеволода Чаплина.

В 2007 году совместно с Михаилом Кузнецовым составил сборник экспертиз "Право против ксеноморфов по вопросам общественной нравственности" - в основном по материалам дел, возбужденных по заказам епископа Екатеринбургского и Верхотурского Никона. Кроме екатеринбургских материалов, в сборнике размещены "православные экспертизы" книг по сексуальной культуре Игоря Кона, а также праздника "День святого Валентина". Понкин и Кузнецов - соавторы труда "О праве на критическую оценку гомосексуализма и о законных ограничениях навязывания гомосексуализма".
Понкин - автор работы о правовой сути экстремизма.

Юридический адрес института Понкина: улица Новослободская, дом 58, строение 5. В этом же здании находится Храм Всемилостивого Спаса, настоятель которого протоиерей Александр Ильяшенко возглавляет отдел Московского патриархата по взаимодействию с вооруженными и правоохранительными силами и проводит службы в домовом храме Генеральной прокуратуры.

Один из первых проектов института Понкина – энциклопедия "Новые религиозные организации России деструктивного, оккультного и неоязыческого характера" - фактически "черного списка" 500 с лишним организаций. В 2007 году Московская Хельсинкская группа, анализируя деятельность института Понкина, пришла к выводу, что эта организация "фактически занимается научно-информационным обеспечением деятельности РПЦ МП".