Anja Schäfer-Bongwald begann ein Architekturstudium und begann sie bei der Stämpfli Werft mit dem Schiffbau am Zürichsee. 1993 machte sie sich als Bootsbauerin zunächst in Bochum und ab 2001 im österreichischen Theresienfeld selbstständig. 2016 zog Schäfer-Bongwald dann nach Berlin.