CTCF
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
CTCF (англ. CCCTC-binding factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727 амінокислот, а молекулярна маса — 82 785[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEGDAVEAIV | EESETFIKGK | ERKTYQRRRE | GGQEEDACHL | PQNQTDGGEV | ||||
VQDVNSSVQM | VMMEQLDPTL | LQMKTEVMEG | TVAPEAEAAV | DDTQIITLQV | ||||
VNMEEQPINI | GELQLVQVPV | PVTVPVATTS | VEELQGAYEN | EVSKEGLAES | ||||
EPMICHTLPL | PEGFQVVKVG | ANGEVETLEQ | GELPPQEDPS | WQKDPDYQPP | ||||
AKKTKKTKKS | KLRYTEEGKD | VDVSVYDFEE | EQQEGLLSEV | NAEKVVGNMK | ||||
PPKPTKIKKK | GVKKTFQCEL | CSYTCPRRSN | LDRHMKSHTD | ERPHKCHLCG | ||||
RAFRTVTLLR | NHLNTHTGTR | PHKCPDCDMA | FVTSGELVRH | RRYKHTHEKP | ||||
FKCSMCDYAS | VEVSKLKRHI | RSHTGERPFQ | CSLCSYASRD | TYKLKRHMRT | ||||
HSGEKPYECY | ICHARFTQSG | TMKMHILQKH | TENVAKFHCP | HCDTVIARKS | ||||
DLGVHLRKQH | SYIEQGKKCR | YCDAVFHERY | ALIQHQKSHK | NEKRFKCDQC | ||||
DYACRQERHM | IMHKRTHTGE | KPYACSHCDK | TFRQKQLLDM | HFKRYHDPNF | ||||
VPAAFVCSKC | GKTFTRRNTM | ARHADNCAGP | DGVEGENGGE | TKKSKRGRKR | ||||
KMRSKKEDSS | DSENAEPDLD | DNEDEEEPAV | EIEPEPEPQP | VTPAPPPAKK | ||||
RRGRPPGRTN | QPKQNQPTAI | IQVEDQNTGA | IENIIVEVKK | EPDAEPAEGE | ||||
EEEAQPAATD | APNGDLTPEM | ILSMMDR |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, розходження хромосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vostrov A.A., Quitschke W.W. (1997). The zinc finger protein CTCF binds to the APBbeta domain of the amyloid beta-protein precursor promoter. Evidence for a role in transcriptional activation. J. Biol. Chem. 272: 33353—33359. PMID 9407128 DOI:10.1074/jbc.272.52.33353
- Klenova E.M., Morse H.C. III, Ohlsson R., Lobanenkov V.V. (2002). The novel BORIS + CTCF gene family is uniquely involved in the epigenetics of normal biology and cancer. Semin. Cancer Biol. 12: 399—414. PMID 12191639 DOI:10.1016/S1044-579X(02)00060-3
- Chao W., Huynh K.D., Spencer R.J., Davidow L.S., Lee J.T. (2002). CTCF, a candidate trans-acting factor for X-inactivation choice. Science. 295: 345—347. PMID 11743158 DOI:10.1126/science.1065982
- Ishihara K., Oshimura M., Nakao M. (2006). CTCF-dependent chromatin insulator is linked to epigenetic remodeling. Mol. Cell. 23: 733—742. PMID 16949368 DOI:10.1016/j.molcel.2006.08.008
- Majumder P., Gomez J.A., Chadwick B.P., Boss J.M. (2008). The insulator factor CTCF controls MHC class II gene expression and is required for the formation of long-distance chromatin interactions. J. Exp. Med. 205: 785—798. PMID 18347100 DOI:10.1084/jem.20071843
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CTCF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13723 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P49711 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
![]() |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |