Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HES5
Ідентифікатори
Символи
HES5 , bHLHb38, hes family bHLH transcription factor 5
Зовнішні ІД
OMIM : 607348 MGI: 104876 HomoloGene: 7755 GeneCards: HES5
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein dimerization activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding • sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро • компонент клітини
Біологічний процес
• Сигнальний шлях Notch • auditory receptor cell fate determination • establishment of epithelial cell polarity • диференціація клітин • negative regulation of astrocyte differentiation • regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • inner ear receptor cell stereocilium organization • comma-shaped body morphogenesis • metanephric nephron tubule morphogenesis • chondrocyte differentiation • central nervous system myelination • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cell maturation • negative regulation of forebrain neuron differentiation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • negative regulation of stem cell differentiation • neuronal stem cell population maintenance • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • glial cell fate commitment • telencephalon development • brain development • inner ear auditory receptor cell differentiation • адгезія клітин • astrocyte differentiation • cartilage development • forebrain radial glial cell differentiation • regulation of myelination • negative regulation of oligodendrocyte differentiation • S-shaped body morphogenesis • neural tube development • neuron differentiation • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of BMP signaling pathway • negative regulation of pro-B cell differentiation • регуляція диференціювання клітин • smoothened signaling pathway • oligodendrocyte development • camera-type eye development • specification of loop of Henle identity • regulation of epithelial cell proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of inner ear receptor cell differentiation • regulation of neurogenesis • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • positive regulation of Notch signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • GO:0034622 protein-containing complex assembly • somitogenesis • central nervous system development • anterior/posterior pattern specification • negative regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 2.53 – 2.53 Mb
Хр. 4: 155.05 – 155.05 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HES5 (англ. Hes family bHLH transcription factor 5 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 166 амінокислот , а молекулярна маса — 18 226[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAPSTVAVEL LSPKEKNRLR KPVVEKMRRD RINSSIEQLK LLLEQEFARH
QPNSKLEKAD ILEMAVSYLK HSKAFVAAAG PKSLHQDYSE GYSWCLQEAV
QFLTLHAASD TQMKLLYHFQ RPPAAPAAPA KEPKAPGAAP PPALSAKATA
AAAAAHQPAC GLWRPW
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human HES2, HES3, and HES5 genes in silico. Int. J. Oncol . 25 : 529—534. PMID 15254753
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші