TRIM5
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
TRIM5 (англ. Tripartite motif containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 493 амінокислот, а молекулярна маса — 56 338[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASGILVNVK | EEVTCPICLE | LLTQPLSLDC | GHSFCQACLT | ANHKKSMLDK | ||||
GESSCPVCRI | SYQPENIRPN | RHVANIVEKL | REVKLSPEGQ | KVDHCARHGE | ||||
KLLLFCQEDG | KVICWLCERS | QEHRGHHTFL | TEEVAREYQV | KLQAALEMLR | ||||
QKQQEAEELE | ADIREEKASW | KTQIQYDKTN | VLADFEQLRD | ILDWEESNEL | ||||
QNLEKEEEDI | LKSLTNSETE | MVQQTQSLRE | LISDLEHRLQ | GSVMELLQGV | ||||
DGVIKRTENV | TLKKPETFPK | NQRRVFRAPD | LKGMLEVFRE | LTDVRRYWVD | ||||
VTVAPNNISC | AVISEDKRQV | SSPKPQIIYG | ARGTRYQTFV | NFNYCTGILG | ||||
SQSITSGKHY | WEVDVSKKTA | WILGVCAGFQ | PDAMCNIEKN | ENYQPKYGYW | ||||
VIGLEEGVKC | SAFQDSSFHT | PSVPFIVPLS | VIICPDRVGV | FLDYEACTVS | ||||
FFNITNHGFL | IYKFSHCSFS | QPVFPYLNPR | KCGVPMTLCS | PSS |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, автофагія, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
- Yap M.W., Nisole S., Lynch C., Stoye J.P. (2004). Trim5alpha protein restricts both HIV-1 and murine leukemia virus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10786—10791. PMID 15249690 DOI:10.1073/pnas.0402876101
- Sawyer S.L., Wu L.I., Akey J.M., Emerman M., Malik H.S. (2006). High-frequency persistence of an impaired allele of the retroviral defense gene TRIM5alpha in humans. Curr. Biol. 16: 95—100. PMID 16401428 DOI:10.1016/j.cub.2005.11.045
- Yamauchi K., Wada K., Tanji K., Tanaka M., Kamitani T. (2008). Ubiquitination of E3 ubiquitin ligase TRIM5 alpha and its potential role. FEBS J. 275: 1540—1555. PMID 18312418 DOI:10.1111/j.1742-4658.2008.06313.x
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Passerini L.D., Keckesova Z., Towers G.J. (2006). Retroviral restriction factors Fv1 and TRIM5alpha act independently and can compete for incoming virus before reverse transcription. J. Virol. 80: 2100—2105. PMID 16474118 DOI:10.1128/JVI.80.5.2100-2105.2006
- Li Y., Li X., Stremlau M., Lee M., Sodroski J. (2006). Removal of arginine 332 allows human TRIM5alpha to bind human immunodeficiency virus capsids and to restrict infection. J. Virol. 80: 6738—6744. PMID 16809279 DOI:10.1128/JVI.00270-06
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16276 (англ.) . Архів оригіналу за 12 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9C035 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
![]() |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |