Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
DLX6
Ідентифікатори
Символи
DLX6 , distal-less homeobox 6
Зовнішні ІД
OMIM : 600030 MGI: 101927 HomoloGene: 87855 GeneCards: DLX6
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• skeletal system development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • embryonic limb morphogenesis • epithelial cell differentiation • inner ear morphogenesis • anatomical structure formation involved in morphogenesis • positive regulation of epithelial cell proliferation • roof of mouth development • head development • multicellular organism development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 97.01 – 97.01 Mb
Хр. 6: 6.86 – 6.87 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
DLX6 (англ. Distal-less homeobox 6 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 175 амінокислот , а молекулярна маса — 19 708[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSHSQHSPYL QSYHNSSAAA QTRGDDTDQQ KTTVIENGEI RFNGKGKKIR
KPRTIYSSLQ LQALNHRFQQ TQYLALPERA ELAASLGLTQ TQVKIWFQNK
RSKFKKLLKQ GSNPHESDPL QGSAALSPRS PALPPVWDVS ASAKGVSMPP
NSYMPGYSHW YSSPHQDTMQ RPQMM
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші