LHX3

LHX3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JTN, 2RGT
Ідентифікатори
Символи	LHX3, CPHD3, LIM3, M2-LIM homeobox 3
Зовнішні ІД	OMIM: 600577 MGI: 102673 HomoloGene: 7814 GeneCards: LHX3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • transcription regulator complex • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • ventral spinal cord interneuron specification • диференціація клітин • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • spinal cord association neuron differentiation • spinal cord motor neuron cell fate specification • placenta development • lung development • negative regulation of apoptotic process • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • animal organ morphogenesis • inner ear development • medial motor column neuron differentiation • motor neuron axon guidance • dorsal/ventral pattern formation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8022	16871
Ensembl	ENSG00000107187	ENSMUSG00000026934
UniProt	Q9UBR4	P50481
RefSeq (мРНК)	NM_014564 NM_178138 NM_001363746	NM_001039653 NM_010711
RefSeq (білок)	NP_055379 NP_835258 NP_001350675	NP_001034742 NP_034841
Локус (UCSC)	Хр. 9: 136.2 – 136.21 Mb	Хр. 2: 26.09 – 26.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LHX3 (англ. LIM homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 43 358.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLETGLERD		RARPGAAAVC		TLGGTREIPL		CAGCDQHILD		RFILKALDRH
WHSKCLKCSD		CHTPLAERCF		SRGESVYCKD		DFFKRFGTKC		AACQLGIPPT
QVVRRAQDFV		YHLHCFACVV		CKRQLATGDE		FYLMEDSRLV		CKADYETAKQ
REAEATAKRP		RTTITAKQLE		TLKSAYNTSP		KPARHVREQL		SSETGLDMRV
VQVWFQNRRA		KEKRLKKDAG		RQRWGQYFRN		MKRSRGGSKS		DKDSVQEGQD
SDAEVSFPDE		PSLAEMGPAN		GLYGSLGEPT		QALGRPSGAL		GNFSLEHGGL
AGPEQYRELR		PGSPYGVPPS		PAAPQSLPGP		QPLLSSLVYP		DTSLGLVPSG
APGGPPPMRV		LAGNGPSSDL		STGSSGGYPD		FPASPASWLD		EVDHAQF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Parker G.E., West B.E., Witzmann F.A., Rhodes S.J. (2005). Serine/threonine/tyrosine phosphorylation of the LHX3 LIM-homeodomain transcription factor. J. Cell. Biochem. 94: 67—80. PMID 15517599 DOI:10.1002/jcb.20287
• Colvin S.C., Malik R.E., Showalter A.D., Sloop K.W., Rhodes S.J. (2011). Model of pediatric pituitary hormone deficiency separates the endocrine and neural functions of the LHX3 transcription factor in vivo. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 173—178. PMID 21149718 DOI:10.1073/pnas.1009501108

Див. також

• Хромосома 9