SLC22A1

SLC22A1
Ідентифікатори
Символи	SLC22A1, HOCT1, OCT1, oct1_cds, solute carrier family 22 member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602607 MGI: 108111 HomoloGene: 20665 GeneCards: SLC22A1
Реагує на сполуку
	клонідин
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005333 norepinephrine:sodium symporter activity; • protein homodimerization activity; • GO:0022891 transmembrane transporter activity; • transporter activity; • acetylcholine transmembrane transporter activity; • monoamine transmembrane transporter activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • secondary active organic cation transmembrane transporter activity; • quaternary ammonium group transmembrane transporter activity; • organic cation transmembrane transporter activity; • organic anion transmembrane transporter activity; • dopamine:sodium symporter activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • basolateral plasma membrane;
Біологічний процес	• establishment or maintenance of transmembrane electrochemical gradient; • xenobiotic transmembrane transport; • quaternary ammonium group transport; • acetate ester transport; • cation transport; • ion transport; • monoamine transport; • norepinephrine transport; • epinephrine transport; • organic cation transport; • dopamine transport; • protein homooligomerization; • ammonium transmembrane transport; • трансмембранний транспорт; • neurotransmitter transport; • organic anion transport; • norepinephrine uptake; • dopamine uptake;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6580
	20517
	ENSG00000175003
	ENSMUSG00000023829
	O15245
	O08966
	NM_003057; NM_153187
	NM_009202
	NP_003048; NP_694857
	NP_033228
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SLC22A1 (англ. Solute carrier family 22 member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 554 амінокислот, а молекулярна маса — 61 154^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPTVDDILEQ	VGESGWFQKQ	AFLILCLLSA	AFAPICVGIV	FLGFTPDHHC
QSPGVAELSQ	RCGWSPAEEL	NYTVPGLGPA	GEAFLGQCRR	YEVDWNQSAL
SCVDPLASLA	TNRSHLPLGP	CQDGWVYDTP	GSSIVTEFNL	VCADSWKLDL
FQSCLNAGFL	FGSLGVGYFA	DRFGRKLCLL	GTVLVNAVSG	VLMAFSPNYM
SMLLFRLLQG	LVSKGNWMAG	YTLITEFVGS	GSRRTVAIMY	QMAFTVGLVA
LTGLAYALPH	WRWLQLAVSL	PTFLFLLYYW	CVPESPRWLL	SQKRNTEAIK
IMDHIAQKNG	KLPPADLKML	SLEEDVTEKL	SPSFADLFRT	PRLRKRTFIL
MYLWFTDSVL	YQGLILHMGA	TSGNLYLDFL	YSALVEIPGA	FIALITIDRV
GRIYPMAMSN	LLAGAACLVM	IFISPDLHWL	NIIIMCVGRM	GITIAIQMIC
LVNAELYPTF	VRNLGVMVCS	SLCDIGGIIT	PFIVFRLREV	WQALPLILFA
VLGLLAAGVT	LLLPETKGVA	LPETMKDAEN	LGRKAKPKEN	TIYLKVQTSE
PSGT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Hayer M., Boenisch H., Bruess M. (1999). Molecular cloning, functional characterization and genomic organization of four alternatively spliced isoforms of the human organic cation transporter 1 (hOCT1/SLC22A1). Ann. Hum. Genet. 63: 473—482. PMID 11388889 DOI:10.1046/j.1469-1809.2000.6430267.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Saborowski M., Kullak-Ublick G.A., Eloranta J.J. (2006). The human organic cation transporter-1 gene is transactivated by hepatocyte nuclear factor-4alpha. J. Pharmacol. Exp. Ther. 317: 778—785. PMID 16436500 DOI:10.1124/jpet.105.099929
Dias V., Ribeiro V. (2007). The expression of the solute carriers NTCP and OCT-1 is regulated by cholesterol in HepG2 cells. Fundam. Clin. Pharmacol. 21: 445—450. PMID 17635184 DOI:10.1111/j.1472-8206.2007.00517.x
Zhang L., Schaner M.E., Giacomini K.M. (1998). Functional characterization of an organic cation transporter (hOCT1) in a transiently transfected human cell line (HeLa). J. Pharmacol. Exp. Ther. 286: 354—361. PMID 9655880
Hayer M., Bonisch H., Bruss M. (2000). Ann. Hum. Genet. 64: 267—267. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Solute carrier family 22 member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10963 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O15245 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Solute carrier family 22 member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10963 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O15245 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

SLC22A1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук