SYCP1

SYCP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4YTO
Ідентифікатори
Символи	SYCP1, CT8, HOM-TES-14, SCP-1, SCP1, synaptonemal complex protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602162 MGI: 105931 HomoloGene: 2389 GeneCards: SYCP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • double-stranded DNA binding Клітинна компонента • condensed nuclear chromosome • central element • male germ cell nucleus • хромосома • transverse filament • клітинне ядро • synaptonemal complex • центромера Біологічний процес • lateral element assembly • Сперматогенез • GO:0007126 мейоз • GO:0035093 sperm DNA condensation • regulation of protein localization • meiotic DNA repair synthesis • chiasma assembly • поділ клітини • клітинний цикл • synaptonemal complex assembly • homologous chromosome pairing at meiosis • reciprocal meiotic recombination • protein homotetramerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6847	20957
Ensembl	ENSG00000198765	ENSMUSG00000027855
UniProt	Q15431	Q62209
RefSeq (мРНК)	NM_001282541 NM_001282542 NM_003176	NM_011516
RefSeq (білок)	NP_001269470 NP_001269471 NP_003167 NP_001269470.1 NP_003167.2	NP_035646
Локус (UCSC)	Хр. 1: 114.85 – 115 Mb	Хр. 3: 102.73 – 102.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYCP1 (англ. Synaptonemal complex protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 976 амінокислот, а молекулярна маса — 114 192.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEKQKPFALF		VPPRSSSSQV		SAVKPQTLGG		DSTFFKSFNK		CTEDDFEFPF
AKTNLSKNGE		NIDSDPALQK		VNFLPVLEQV		GNSDCHYQEG		LKDSDLENSE
GLSRVYSKLY		KEAEKIKKWK		VSTEAELRQK		ESKLQENRKI		IEAQRKAIQE
LQFGNEKVSL		KLEEGIQENK		DLIKENNATR		HLCNLLKETC		ARSAEKTKKY
EYEREETRQV		YMDLNNNIEK		MITAFEELRV		QAENSRLEMH		FKLKEDYEKI
QHLEQEYKKE		INDKEKQVSL		LLIQITEKEN		KMKDLTFLLE		ESRDKVNQLE
EKTKLQSENL		KQSIEKQHHL		TKELEDIKVS		LQRSVSTQKA		LEEDLQIATK
TICQLTEEKE		TQMEESNKAR		AAHSFVVTEF		ETTVCSLEEL		LRTEQQRLEK
NEDQLKILTM		ELQKKSSELE		EMTKLTNNKE		VELEELKKVL		GEKETLLYEN
KQFEKIAEEL		KGTEQELIGL		LQAREKEVHD		LEIQLTAITT		SEQYYSKEVK
DLKTELENEK		LKNTELTSHC		NKLSLENKEL		TQETSDMTLE		LKNQQEDINN
NKKQEERMLK		QIENLQETET		QLRNELEYVR		EELKQKRDEV		KCKLDKSEEN
CNNLRKQVEN		KNKYIEELQQ		ENKALKKKGT		AESKQLNVYE		IKVNKLELEL
ESAKQKFGEI		TDTYQKEIED		KKISEENLLE		EVEKAKVIAD		EAVKLQKEID
KRCQHKIAEM		VALMEKHKHQ		YDKIIEERDS		ELGLYKSKEQ		EQSSLRASLE
IELSNLKAEL		LSVKKQLEIE		REEKEKLKRE		AKENTATLKE		KKDKKTQTFL
LETPEIYWKL		DSKAVPSQTV		SRNFTSVDHG		ISKDKRDYLW		TSAKNTLSTP
LPKAYTVKTP		TKPKLQQREN		LNIPIEESKK		KRKMAFEFDI		NSDSSETTDL
LSMVSEEETL		KTLYRNNNPP		ASHLCVKTPK		KAPSSLTTPG		STLKFGAIRK
MREDRWAVIA		KMDRKKKLKE		AEKLFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мейоз, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

• Meuwissen R.L.J., Meerts I., Hoovers J.M.N., Leschot N.J., Heyting C. (1997). Human synaptonemal complex protein 1 (SCP1): isolation and characterization of the cDNA and chromosomal localization of the gene. Genomics. 39: 377—384. PMID 9119375 DOI:10.1006/geno.1996.4373
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Park H.H. (2015). X-ray crystallographic studies of the middle part of the human synaptonemal complex protein 1 coiled-coil domain. Acta Crystallogr. F. 71: 1131—1134. PMID 26323297 DOI:10.1107/S2053230X15012728

Див. також

• Хромосома 1