TRDN

TRDN
Ідентифікатори
Символи	TRDN, CPVT5, TDN, TRISK, triadin, CARDAR
Зовнішні ІД	OMIM: 603283 MGI: 1924007 HomoloGene: 38137 GeneCards: TRDN
Пов'язані генетичні захворювання
catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia 5
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-macromolecule adaptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding • transmembrane transporter binding Клітинна компонента • voltage-gated calcium channel complex • integral component of membrane • мембрана • junctional sarcoplasmic reticulum membrane • sarcoplasmic reticulum • ендоплазматичний ретикулум • sarcoplasmic reticulum membrane • junctional membrane complex • sarcoplasmic reticulum lumen • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • positive regulation of cell communication by electrical coupling involved in cardiac conduction • regulation of cardiac conduction • м'язове скорочення • release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • cellular calcium ion homeostasis • endoplasmic reticulum membrane organization • negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity • positive regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity • ion transmembrane transport • cytoplasmic microtubule organization • regulation of cell communication by electrical coupling • heart contraction • regulation of cardiac muscle cell membrane potential • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum • response to bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10345	76757
Ensembl	ENSG00000186439	ENSMUSG00000019787
UniProt	Q13061	E9Q9K5
RefSeq (мРНК)	NM_001251987 NM_001256020 NM_001256021 NM_001256022 NM_006073	NM_029726 NM_001364696 NM_001364697
RefSeq (білок)	NP_001238916 NP_001242949 NP_001242950 NP_001242951 NP_006064 NP_001242950.1	NP_084002 NP_001351625 NP_001351626
Локус (UCSC)	Хр. 6: 123.22 – 123.64 Mb	Хр. 10: 32.96 – 33.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRDN (англ. Triadin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 729 амінокислот, а молекулярна маса — 81 595.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTEITAEGNA		STTTTVIDSK		NGSVPKSPGK		VLKRTVTEDI		VTTFSSPAAW
LLVIALIITW		SAVAIVMFDL		VDYKNFSASS		IAKIGSDPLK		LVRDAMEETT
DWIYGFFSLL		SDIISSEDEE		DDDGDEDTDK		GEIDEPPLRK		KEIHKDKTEK
QEKPERKIQT		KVTHKEKEKG		KEKVREKEKP		EKKATHKEKI		EKKEKPETKT
LAKEQKKAKT		AEKSEEKTKK		EVKGGKQEKV		KQTAAKVKEV		QKTPSKPKEK
EDKEKAAVSK		HEQKDQYAFC		RYMIDIFVHG		DLKPGQSPAI		PPPLPTEQAS
RPTPASPALE		EKEGEKKKAE		KKVTSETKKK		EKEDIKKKSE		KETAIDVEKK
EPGKASETKQ		GTVKIAAQAA		AKKDEKKEDS		KKTKKPAEVE		QPKGKKQEKK
EKHVEPAKSP		KKEHSVPSDK		QVKAKTERAK		EEIGAVSIKK		AVPGKKEEKT
TKTVEQEIRK		EKSGKTSSIL		KDKEPIKGKE		EKVPASLKEK		EPETKKDEKM
SKAGKEVKPK		PPQLQGKKEE		KPEPQIKKEA		KPAISEKVQI		HKQDIVKPEK
TVSHGKPEEK		VLKQVKAVTI		EKTAKPKPTK		KAEHREREPP		SIKTDKPKPT
PKGTSEVTES		GKKKTEISEK		ESKEKADMKH		LREEKVSTRK		ESLQLHNVTK
AEKPARVSKD		VEDVPASKKA		KEGTEDVSPT		KQKSPISFFQ		CVYLDGYNGY
GFQFPFTPAD		RPGESSGQAN		SPGQKQQGQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Houle T.D., Ram M.L., Cala S.E. (2004). Calsequestrin mutant D307H exhibits depressed binding to its protein targets and a depressed response to calcium. Cardiovasc. Res. 64: 227—233. PMID 15485681 DOI:10.1016/j.cardiores.2004.09.009

Див. також

• Хромосома 6