ZNF687

ZNF687
Ідентифікатори
Символи	ZNF687, PDB6, zinc finger protein 687
Зовнішні ІД	OMIM: 610568 MGI: 1925516 HomoloGene: 10827 GeneCards: ZNF687
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57592	78266
Ensembl	ENSG00000143373	ENSMUSG00000019338
UniProt	Q8N1G0	Q9D2D7
RefSeq (мРНК)	NM_001304763 NM_001304764 NM_020832	NM_030074 NM_001357863
RefSeq (білок)	NP_001291692 NP_001291693 NP_065883	NP_084350 NP_001344792
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.28 – 151.29 Mb	Хр. 3: 95.01 – 95.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF687 (англ. Zinc finger protein 687) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 237 амінокислот, а молекулярна маса — 129 529.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDMKTPDFD		DLLAAFDIPD		IDANEAIHSG		PEENEGPGGP		GKPEPGVGSE
SEDTAAASAG		DGPGVPAQAS		DHGLPPPDIS		VVSVIVKNTV		CPEQSEALAG
GSAGDGAQAA		GVTKEGPVGP		HRMQNGFGSP		EPSLPGTPHS		PAPPSGGTWK
EKGMEGKTPL		DLFAHFGPEP		GDHSDPLPPS		APSPTREGAL		TPPPFPSSFE
LAQENGPGMQ		PPVSSPPLGA		LKQESCSPHH		PQVLAQQGSG		SSPKATDIPA
SASPPPVAGV		PFFKQSPGHQ		SPLASPKVPV		CQPLKEEDDD		EGPVDKSSPG
SPQSPSSGAE		AADEDSNDSP		ASSSSRPLKV		RIKTIKTSCG		NITRTVTQVP
SDPDPPAPLA		EGAFLAEASL		LKLSPATPTS		EGPKVVSVQL		GDGTRLKGTV
LPVATIQNAS		TAMLMAASVA		RKAVVLPGGT		ATSPKMIAKN		VLGLVPQALP
KADGRAGLGT		GGQKVNGASV		VMVQPSKTAT		GPSTGGGTVI		SRTQSSLVEA
FNKILNSKNL		LPAYRPNLSP		PAEAGLALPP		TGYRCLECGD		AFSLEKSLAR
HYDRRSMRIE		VTCNHCARRL		VFFNKCSLLL		HAREHKDKGL		VMQCSHLVMR
PVALDQMVGQ		PDITPLLPVA		VPPVSGPLAL		PALGKGEGAI		TSSAITTVAA
EAPVLPLSTE		PPAAPATSAY		TCFRCLECKE		QCRDKAGMAA		HFQQLGPPAP
GATSNVCPTC		PMMLPNRCSF		SAHQRMHKNR		PPHVCPECGG		NFLQANFQTH
LREACLHVSR		RVGYRCPSCS		VVFGGVNSIK		SHIQTSHCEV		FHKCPICPMA
FKSGPSAHAH		LYSQHPSFQT		QQAKLIYKCA		MCDTVFTHKP		LLSSHFDQHL
LPQRVSVFKC		PSCPLLFAQK		RTMLEHLKNT		HQSGRLEETA		GKGAGGALLT
PKTEPEELAV		SQGGAAPATE		ESSSSSEEEE		VPSSPEPPRP		AKRPRRELGS
KGLKGGGGGP		GGWTCGLCHS		WFPERDEYVA		HMKKEHGKSV		KKFPCRLCER
SFCSAPSLRR		HVRVNHEGIK		RVYPCRYCTE		GKRTFSSRLI		LEKHVQVRHG
LQLGAQSPGR		GTTLARGSSA		RAQGPGRKRR		QSSDSCSEEP		DSTTPPAKSP
RGGPGSGGHG		PLRYRSSSST		EQSLMMGLRV		EDGAQQCLDC		GLCFASPGSL
SRHRFISHKK		RRGVGKASAL		GLGDGEEEAP		PSRSDPDGGD		SPLPASGGPL
TCKVCGKSCD		SPLNLKTHFR		THGMAFIRAR		QGAVGDN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 1