Ravnateljica predstavlja i zastupa Institut, a za svoj je rad odgovorna Upravnom vijeću Instituta
Upravno vijeće donosi opće akte Instituta, vodi financijsku i poslovnu politiku te donosi programe rada i razvoja. Ima pet članova, a predsjednika imenuje ministar.
Predsjednik: dr. sc. Marinko Vuković
Zamjenik predsjednika: dr. sc. Matijas Baković
Članovi: dr. sc. Dragutin Babić, prof. dr. sc. Vanda Babić Galić, dr. sc. Ivan Balabanić, dr. sc. Krešimir Dabo, dr. sc. Darko Gavrilović, dr. sc. Margareta Gregurović, dr. sc. Snježana Gregurović, dr. sc. Sanja Klempić Bogadi, dr. sc. Sanja Lazanin, dr. sc. Maria Florencia Luchetti, dr. sc. Ana Malnar, dr. sc. Dubravka Mlinarić, dr. sc. Dragan Nimac, dr. sc. Marina Perić Kaselj, dr. sc. Ana Perinić Lewis, dr. sc. Sonja Podgorelec, dr. sc. Kristina Posavec, dr. sc. Natasha Kathleen Ružić, dr. sc. Nikola Šimunić, dr. sc. Filip Škiljan, dr. sc. Maja Vizjak
Predstavnik zaposlenika na suradničkim radnim mjestima: Vjekoslav Blazsetin, asistent.
Znanstveno vijeće je stručno tijelo Instituta. Ono, između ostalog, utvrđuje i provodi znanstvenu politiku Instituta te raspravlja i odlučuje o znanstvenim i stručnim pitanjima.