Внутренние помещения собора, соединённые между собой лабиринтом переходов, отличаются небольшими размерами и маленькой вместимостью. В дни больших церковных праздников жители Москвы и священнослужители собирались на Красной площади.

Духовенство храма располагалось на Лобном месте, на котором устанавливался аналой, а сам собор служил своеобразным огромным алтарём условного храма под открытым небом.Советский и российский филолог, академик Дмитрий Лихачёв высказывал мнение о том, что собор оказался своего рода символом русского характера: «храмина-домина вроде бы огромна, широка, размашиста, а войдёшь внутрь — так и помолиться-то особенно негде, малы и тесны клетушки-церквушки»

В 1812 году в подклете Покровского собора занявшие Москву французы держали лошадей.

Существует легенда, что Наполеон Бонапарт, восхищённый красотой храма, намеревался перевезти его во Францию.Однако когда понял, что это невозможно, решил взорвать собор. По легенде, дождь загасил фитили французских пушек после молитвы москвичей. Документальных подтверждений этой истории нет 

 
Ещё одно предание гласит, что Наполеон, подъехав к Кремлю 3 (15) сентября около трёх часов дня, сказал: «Сожгите эту мечеть». Взрыва не произошло, но вся утварь, ризница и иконостасы были разграблены и осквернены. Был похищен даже железный колпак с мощей блаженного Иоанна юродивого.

Крышу собора сильно повредили камни от взорванных кремлёвских строений

В Покровском соборе отсутствуют подвалы. Церкви и галереи стоят на едином основании — подклете, состоящем из нескольких помещений. Прочные кирпичные стены подклета до 3 м в толщину перекрыты сводами. Высота помещений составляет около 6,5 м 

Раньше помещения подклета были недоступны для прихожан. Глубокие ниши-тайники в нём использовали как хранилища. Их закрывали дверями, от которых до наших дней сохранились только петли. До 1595 года в подклете, возможно, прятали царскую казну.

Существует предание, что зажиточные горожане также приносили сюда на хранение своё имущество 

В подклет вела внутристенная белокаменная лестница из центральной церкви Покрова Пресвятой Богородицы, о которой знали только посвящённые. Позднее этот узкий ход был заложен, однако в процессе реставрации 1930-х годов потайную лестницу обнаружили 

Открывшееся при ремонте в начале 2010-х годов потайное помещение представляет собой неглубокое подполье высотой менее двух метров между полом ризницы и верхними сводами находящейся ниже паперти. Архитекторы-реставраторы объясняют существование этого помещения строительными потребностями. На сегодняшний день все желающие могут посетить это помещение 

В подклете находятся некоторые иконы. Самая древняя из них — икона святого Василия Блаженного конца XVI века — написана специально для Покровского собора. Также там экспонируются две иконы XVII века — «Покров Пресвятой Богородицы» и «Богоматерь Знамение».

Вторая написана в 1780-х годах и является списком фасадной иконы, расположенной на восточной стене собора. Ранее список располагался над входом в придел Василия Блаженного

===========================

Молокова Т. А., Фролов В. П. История Москвы в памятниках культуры к 850-летию столицы. — Московский лицей, 1997. — C. 88

Московский Кремль: собор Покрова Пресвятой Богородицы на Рву (храм Василия Блаженного). Официальный сайт Московского Патриархата (2017). Дата обращения: 27 октября 2017.

http://www.patriarchia.ru/db/text/277545.html

Архитектурные ансамбли Москвы, 1997, с. 65.

Осипов Г. «И стояла та церковь такая, что словно приснилась…»: Храм Василия блаженного начал отмечать 450-летие // Культура. — 2011. — № 24. — С. 1.

Чаев Н. А. О русском старинном церковном зодчестве // Древняя и Новая Россия. — 1875. — № 6. — С. 142-144.